Shkupi sot është qyteti i dytë më i ndotur në botë, ndërsa para tij është vetëm Daka në Bangladesh.
Ndërkaq të dhënat nga stacionet matëse të cilësissë së ajrit të Ministrisë së Mjedisit, tregojnë se Shkupi dhe Kavadari mëngjesin e sotëm janë qytetet më të ndotura në Maqedoninë e Veriut.